En la Biblioteca se conservan más de 10.000 volúmenes destacando una vitrina con los 350 libros más antiguos de los siglos XVI, XVII y XVIII sobre medicina general, oftalmología, anatomía y farmacia (farmacopeas y recetarios).
Otras colecciones interesantes son las de cerámica farmacéutica, vidrio farmacéutico, morteros, ex libris, grabados e instrumental médico y farmacéutico.
El Museo se puede visitar en dos jornadas de puertas abiertas cada año o bien concertando cita previa.